Может ли заказчик отказаться от заключения контракта с победителем аукциона, если было отозвано финансирование?

Нет, не может. Такой вывод делает арбитражная практика (см., напр., Решение АС Мурманской области от 18.03.2015 № А42‑8181/2014). При этом суды ссылаются на ч. 9 ст. 31 Федерального закона от 05.04.2013 № 44‑ФЗ. В этой норме установлен исчерпывающий список оснований для отказа в заключение контракта. Отзыв финансирования не упоминается.